由于秋苗发病面积小、病情轻，且西南地区、汉水流域等主要冬繁区冬季气温偏低、降水偏少，小麦条锈病冬季扩展缓慢。截至2月底（2013年2月27日），全国小麦条锈病冬繁面积为31.6万亩，仅为轻发的2011年同期的二分之一，比2012年同期减少62.8%；发病范围涉及四川、云南、贵州、重庆、甘肃、陕西、湖北7省（市）的30个市（地区）95个县（区、市），发病县点数比轻发的2011年同期减少15个，比2012年同期减少35个。
四川省最早于2012年11月20日在绵阳市梓潼县见病，全省始见期比2011年提前1天，属偏早发生年份；此后，绵阳、广元、德阳、南充等盆地北部地区以及凉山、攀枝花等攀西地区陆续在1-2月份显症，遂宁、资阳、眉山等盆地中部地区以及泸州等盆地南部地区在2月中下旬显症。截至2月底，全省共有10个市（州）的31个县（区、市）发病，发病面积为10.8万亩；与2012年同期相比，发病县数减少34个，发病面积减少48.3万亩。目前，除广元市剑阁县已进入扩散流行阶段，凉山州宁南县、德昌县处于点片发生期外，其余大部见病地区仍为零星发生。
云南省最早于2012年12月12日在临沧市永德县、丽江市永胜县见病，全省始见期与2011年相同，大部地区始见期在12月底以后，普遍晚于常年。截至2月底，全省共有临沧、丽江、昆明、曲靖、楚雄、玉溪、大理、迪庆、西双版纳、德宏、保山、文山、红河等13个市（州）的53个县（区、市）发病，发病面积为15.8万亩；与2012年同期相比，发病县数增加1个，发病面积减少5.2万亩。目前，条锈病主要在早播旱地麦上零星发生，秋播麦苗尚未显症。
湖北省在襄阳和随州市3个区（市）、陕西省在汉中1个县见病，两省始见期分别为2012年11月28日、11月21日，比2011年分别晚2天、7天。目前，两省发生面积分别为3.6万亩、0.3万亩，均为零星发生。
重庆和贵州始见期在2月中、下旬，接近2012年同期，明显晚于常年；分别在丰都、梁平、南川和六盘水及毕节零星发生。
甘肃省仅在陇南市2个县川坝区查见条锈病零星病叶，发生面积1.1万亩。
河南省目前尚未见病。
据国家气候中心预测，3月份，西南、西北和汉水流域等条锈病早春流行区气温正常或偏高，大部区域降水正常或偏少，其中云南、四川南部、贵州大部偏少2至5成，对病害发生流行有一定不利影响，预计3月底全国小麦条锈病发生面积200万亩。
鉴于小麦条锈病发生流行受气候条件影响大，且区域间、品种间、地块间差异大，各地区应高度重视，加强病情监测，及时掌握病情发生动态。西南地区、汉水流域、陕甘南部等条锈病冬繁区要继续开展定点系统调查和面上普查工作，准确发布中短期趋势预报，并积极进行有效的早期控制；湖北江汉平原、河南南部等关键桥梁区要密切关注条锈病传播动态，及早开展带药侦察，努力减轻病害向江淮、黄淮及华北地区蔓延程度，保障小麦生长安全。
