为害大蒜的根蛆以幼虫在地表1-4厘米上层取食大蒜幼嫩鳞茎汁液、或幼虫钻入蒜瓣内吸食为害，形成黄褐色孔洞，进一步引起蒜瓣腐烂、蒜头变小、蒜头开裂。据调查，大蒜根蛆对大蒜的危害一般损失10%-30%，严重年份则更高。
一、根蛆的农业防治
1、精选蒜种，提高播种质量。尽可能选用异地调运的种蒜及脱毒大蒜品种；选择大头蒜，剔除发霉、腐烂的蒜头和蒜瓣，并且剔除蒜头内心小蒜；播种深度以4厘米左右为宜，并覆盖松散土。
2.科学施肥，加强肥水管理。施腐熟饼肥20公斤，磷酸二铵30公斤，尿素10公斤作底肥。生长后期可随灌水追施尿素1-2次，每次8公斤左右。越冬时应浇灌越冬水闷杀越冬幼虫及蛹。。
二、根蛆的化学防治
1、在播种前整地时用5%辛硫磷颗粒剂3-4公斤拌饼肥或细土50公斤结合播种撒施于播种沟内。
2、生长期防治：4月上中旬根据田间调查，在成虫始发期，在大蒜基部撒施一薄层干燥草木灰，可减少产卵。
3、当发现幼虫为害时，可用50%辛硫磷乳油800倍液或90%敌百虫晶体1000倍液灌根，10天一次，视虫情连灌2-3次。