小麦脱粒机的安全装置要齐全，传动部分要有安全防护罩。电机与脱粒机要匹配，严禁未经培训就操作，人数要适当，分工明确，喂入量要均匀、适量。不许用叉子、木杆及其它工具将小麦推入滚筒，人的手臂绝不能伸进喂料口，以防被高速旋转的滚筒打伤。
常见故障：
1、脱粒不净：常见原因有滚筒转速低脱粒间隙大纹杆与凹板磨损严重喂入量太多；排除方法：提高转速，调小间隙，更换凹板，减少喂入量；
2、分离不清：常见的原因有风量不足或风向不对，小麦脱粒机筛孔损坏或间隙过大、谷物太湿；排除方法：调节风量至合适位置检查机器筛孔，调整间隙；
3、滚筒堵塞：原因有谷物太湿且又喂入量太大、滚筒转速过低传动皮带打滑；排除方法：翻晒作物，均匀连续喂入，适当提高转速，调紧皮带张紧度；
4、谷粒破碎：原因是脱粒间隙太小、滚筒转速过高、喂入谷物不匀；排除方法：适当调大间隙，降低转速，均匀连续喂入；
5、小麦脱粒机的滚筒有杂音：纹杆螺栓松动、凹板变形，脱粒间隙小；排除方法：紧固螺钉，检修凹板，调整间隙；
6、小麦脱粒机的电机过热：喂入量过多导致负荷太大、通风不良，热量散不出去；排除方法：减少喂入量，清除电机周围杂物，检查导线和电压。