浅水藕的适宜水位为１０～２０厘米，最大耐水深度为５０厘米，栽培上必须根据浅水藕不同生长期调控好水层。
浅水藕水层管理总的原则是前浅、中深、后浅。栽藕后立叶出现时保持４～７厘米浅水层，以提高土温，促进发芽。随着茎叶生长转旺，水层逐渐加深到１２～１５厘米。终止叶出现后植株开始结藕，水层逐渐降低到４～７厘米深，促进结藕。
浅水藕生长前期，田内眼子草、牛毛毡、矮慈姑、三棱草等杂草和四叶萍、黑藻较多，会影响莲藕生长，应及时除去。莲藕立叶高出水面３０厘米时，用５０％威罗生乳油１００毫升、尿素５公斤拌细土５公斤，在露水干时撒施于田中。施药时保持藕田水深７～１０厘米，保持水层１周以上，持效期可达１个月以上。或者用１２．５％盖草能或３５％精稳杀得４０毫升，加水４０～５０公斤，露水干时喷洒在杂草叶面上，４天后大部分３～４叶期禾本科杂草被杀死。
